Как всегда не буду тянуть заходим в SSH и вводим такую вот строчку
for i in /home/www/grenuy/data/www/*/sites/.. ; do cd "$i"; drush updb; drush en update; yes | drush pm-update ; drush up drupal ; drush updb ; done
grenuy это имя пользователя путь может быть немного видоизмененным в зависимости от сервера.
Скрипт может давать сбои и error, при сбои создается папка с именем drupal-7.** перенеся от туда файлы в корень сайта восстановиться сайт.
обновляет как и 7-ку так и 6-ку в построчечный режим выполнения команд такой(в корне сайта выполняться)
drush en update
drush pm-update
drush up drupal
drush updb