В windows 10 уже есть интегрирован ssh.exe(наконец-то!) и winscp можно настроить так что бы putty, как не крути, более тяжелая программа вообще не запускалась
делается просто
%SystemRoot%\Sysnative\OpenSSH\ssh.exe !U@!@ -p !# -t "cd !/ ; /bin/bash"